- مرکز نیازسنجی و پروژه‌یابی
- مرکز مطالعات پیش نشانگرهای زلزله موسسه ژئوفیزیک
- مرکز مطالعات سیاستگذاری عمومی
- مرکز پژوهشی مشترک دانشگاه تهران و مؤسسه کنفوسیوس
- مرکز پژوهشی مشترک دانشگاه تهران و بنیاد روسکی‌میر
- مرکز پژوهشی آسیا
- مرکز تحقیقات حکمرانی منابع طبیعی
- مرکز پژوهشی مطالعات کشورهای اسپانیایی زبان
- مرکز پژوهشی مشخصه یابی پیشرفته
- مرکز مطالعات آمریکای شمالی و اروپا
- مرکز تحقیقات کنه و بیماری‌های منتقله از کنه‌ها
- مرکز زیست مواد
- مرکز مطالعات اوراسیای مرکزی
- مرکز مطالعات و تحقیقات زنان
- مرکز مطالعات عالی انقلاب اسلامی
- مرکز تحقیقات بیابان
- مرکز مطالعات عالی بین المللی
